A grafia certa é incomodar, com i no início.
A grafia encomodar, com e no início, está incorreta. Portanto seu uso acarretará em um erro de ortografia, devendo ser evitado.
Definição: diz respeito a causar incômodos, ou seja, a perturbar o sossego de outrem.
Frases com incomodar de exemplo
- Não gosto de incomodar ninguém, por isso reflito muito antes de agir.
- Ele insiste em me incomodar.